Le Plan régional santé environnement 4 (PRSE4) est le cadre de référence des actions à mener en matière de santé environnement en Bourgogne-Franche-Comté. Elles tournent autour de plusieurs axes : agir sur les comportements, les environnements favorables à la santé, investir les politiques publiques et les projets territoriaux, et soutenir la recherche et les actions innovantes. Un axe transversal concerne le renforcement des acteurs du réseau santé environnement.
Eset Bourgogne-Franche-Comté est le portail internet de référence pour agir en santé environnementale dans la région.